Отчёты. Счета. Добавить параметр фильтрации "Налог"
Сейчас параметр фильтрации Налог в отчетах есть только при выборе Объекта "Позиции накладных", а для удаления налога из раздела Общие настройки - Справочники - Налоги требуется найти и удалить/отредактировать все счета, в которых используется этот налог.